辞职赔偿公司违约金的数额通常有以下几种情况：

按劳动合同约定或协商确定

违约金的具体数额通常由用人单位与劳动者在劳动合同中约定，或者双方协商确定。

按经济补偿金标准

经济补偿金的标准是按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

按实际损失

违约金的数额也可以根据实际损失来确定，但通常不得超过实际损失的30%。

法律规定的上限

某些地区或情况下，违约金的上限可能会有所规定，例如北京市规定劳动者向用人单位支付的违约金最多不得超过职工本人解除劳动合同前12个月的工资总额。

专项培训费用的扣除

如果用人单位为劳动者提供了专项培训费用，并约定了服务期，劳动者违反服务期约定的，违约金数额不得超过用人单位提供的培训费用。

建议

明确合同条款：首先应查看劳动合同中是否有关于违约金的明确约定，并按照约定执行。

协商一致：如果合同中没有明确约定或双方对违约金数额有分歧，应尽量通过协商达成一致。

法律咨询：如果违约金数额过高或过低，可以咨询专业律师，请求法院适当调整违约金数额。

这些规定和计算方法有助于用人单位和劳动者在辞职时合理确定违约金数额，避免因违约金问题产生不必要的纠纷。