工资超过 5000元的部分需要缴纳个人所得税。具体计算方法是：工资薪金所得减去五险一金（社会保险费和住房公积金）和起征点（5000元）后的余额为应纳税所得额。根据应纳税所得额，适用相应的税率和速算扣除数进行扣税。