新疆疫情主要发生在乌鲁木齐市。根据提供的信息，在2022年8月11日至2022年8月16日期间，新疆报告了多例新增无症状感染者，其中大部分出现在乌鲁木齐市。例如，在2022年8月11日，乌鲁木齐市报告了87例新增无症状感染者，而在2022年8月16日，乌鲁木齐市报告了27例新增无症状感染者。此外，疫情还波及到新疆的其他地区，如伊犁哈萨克自治州、昌吉回族自治州、吐鲁番市等，但主要病例仍集中在乌鲁木齐市