日本大学中的神学部主要学习的内容包括：

1. 宗教研究：包括近代宗教学、古代宗教学等，研究宗教的起源、演化、性质、规律和作用。

2. 宗教学：作为神学的同义词，宗教学是一门综合学科，研究宗教的文化、社会、历史背景，包含语言、艺术、哲学、历史、社会等方面。

3. 哲学、历史：探讨宗教现象、宗教的一般要素的进化和发展、演变的规律和作用。

4. 心理学、民俗学、民族学：研究宗教与人类心理、社会习俗、民族文化的关系。

5. 世界各国宗教：对比研究不同国家和地区的宗教文化。

神学专业的培养目标是培养具有宗教学专业知识和素养的专业人士，适用于政府机构、公共团体、非盈利组织等众多领域。

神学在日本大学中是一门独特且重要的学科，它结合了社会科学和人文科学的研究方法，为学生提供了深入理解和分析宗教现象的机会