如果您持有C类驾照并且被扣了12分，您需要按照以下步骤处理：

处理违章和缴纳罚款：

首先需要处理所有未结清的违章记录并缴纳相应的罚款。

满分教育学习：

在接到通知后，您需要在规定的时间内（通常是15天内）到驾驶证核发地或违法行为地的公安机关交通管理部门参加为期7天的道路交通安全法律、法规和相关知识的学习。

参加考试：

完成学习后，您需要参加道路交通安全法律、法规和相关知识的考试。考试合格后，您的记分将被清除，并且可以领回驾驶证。如果考试不合格，您需要继续参加学习和考试，直到通过为止。

扣留驾驶证：

在参加学习和考试期间，您的驾驶证将被扣留。

请注意，如果您在实习期内驾驶证被扣满12分，注销其实习的准驾车型驾驶资格。

请确保在规定的时间内完成上述步骤，以避免进一步的处罚。