怀孕后公司报销的处理流程如下：

收集资料

女职工怀孕后，需要收集所有相关的医疗费用收据、病历本、准生证等文件资料。

提交报销申请

生完孩子后，女职工应在规定时间内（如产后3个月）向单位递交产检费用报销相关资料。

单位收到资料后，会进行审核，并填写《生育保险费用手工报销审批表》及《本市生育保险手工报销医疗费用申报结算汇总单》。

审核与递交

单位将填写好的报销表格和相关资料递交给辖区社保中心进行审核。

社保中心审核

社保中心审核通过后，将报销款打入单位账户。

发放报销款

单位收到报销费用后，将其发放给职工本人。

注意事项：

确保所有资料齐全且符合报销要求，否则可能会影响报销进度。

不同地区的报销流程和标准可能有所不同，建议提前咨询当地社保部门以获取详细信息。

如果公司未按照规定缴纳生育保险费，则相关费用可能需要由公司自行承担。

通过以上步骤，女职工可以顺利完成怀孕期间的费用报销。