港澳通行证的停留时间主要取决于签注类型，不同类型的签注允许的停留时间如下：

个人旅游

三个月或一年有效，每次可逗留七天。

探亲

三个月一次有效，每次可逗留14天或三个月多次有效，逗留不超过自首次进入之日起90天。

商务

三个月一次或多次有效、一年多次有效，每次逗留不超过七天。

团队旅游

三个月一次或两次，一年一次或两次，每次逗留不超过七天，须随团出入境。

其他

三个月一次或两次有效，一年一次或两次，每次逗留不超过十四天。

逗留

多次有效，出境有效期根据香港或者澳门有关部门批准的期限签发。

综上所述，港澳通行证的停留时间从7天到90天不等，具体取决于签注类型和入境次数。建议在申请签注时仔细阅读相关规定，以确保合规。