农业银行卡的扣费方式如下：

年费

普通储蓄卡的年费标准为10元/年。

贵宾卡一般免年费。

年费通常在每年的年费扣减日（一般是开卡日的次月对应日）一次性从卡内扣减。

小额账户管理费

如果银行卡账户余额小于300元，每季度会收取3元的小额账户管理费。

余额为0的情况下，如果超过半年余额仍为0，则该卡会转为睡眠户，下次使用前需要到柜台激活。

其他费用

异地ATM取款手续费：异地本行ATM跨行取款每笔取款金额的1%，最低1元；异地跨行ATM取款每笔手续费为2元+取款金额的1%。

异地存款手续费：省内异地柜台交易金额的0.5%，最低1元，最高50元；跨省异地柜台交易金额的0.5%，最低1元，最高100元。

如果开通了手机短信功能，可能还会收取每月2元的手机信息费。

建议：

定期检查银行卡余额，确保余额充足以避免小额账户管理费的扣除。

如果不需要某些服务，如手机短信功能，可以关闭以节省费用。

对于长时间不使用的睡眠户，建议及时激活，以免影响使用。